MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET09

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010695	TGTGT	2	10	83	92	0 %	60 %	40 %	0 %	188535904
2	NC_010695	CAG	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535904
3	NC_010695	GAT	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535904
4	NC_010695	ATC	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535904
5	NC_010695	AT	3	6	353	358	50 %	50 %	0 %	0 %	188535904
6	NC_010695	CTAT	2	8	363	370	25 %	50 %	0 %	25 %	188535904
7	NC_010695	TTA	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535904
8	NC_010695	AAAT	2	8	423	430	75 %	25 %	0 %	0 %	188535904
9	NC_010695	AT	3	6	442	447	50 %	50 %	0 %	0 %	188535904
10	NC_010695	GCT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535904
11	NC_010695	GGCC	2	8	643	650	0 %	0 %	50 %	50 %	188535904
12	NC_010695	CAG	2	6	743	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535904
13	NC_010695	CTA	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535904
14	NC_010695	GCAAA	2	10	858	867	60 %	0 %	20 %	20 %	188535904
15	NC_010695	TTC	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535904
16	NC_010695	ACA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535904
17	NC_010695	GAC	2	6	944	949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535904
18	NC_010695	AGC	2	6	985	990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535905
19	NC_010695	GACT	2	8	993	1000	25 %	25 %	25 %	25 %	188535905
20	NC_010695	CAA	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535905
21	NC_010695	A	6	6	1075	1080	100 %	0 %	0 %	0 %	188535905
22	NC_010695	ACG	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535905
23	NC_010695	GCA	2	6	1159	1164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535905
24	NC_010695	GCA	2	6	1196	1201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535905
25	NC_010695	CAA	2	6	1205	1210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535905
26	NC_010695	A	6	6	1209	1214	100 %	0 %	0 %	0 %	188535905
27	NC_010695	A	6	6	1289	1294	100 %	0 %	0 %	0 %	188535905
28	NC_010695	TGC	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535905
29	NC_010695	TGA	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535905
30	NC_010695	A	6	6	1358	1363	100 %	0 %	0 %	0 %	188535905
31	NC_010695	GAA	2	6	1378	1383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535905
32	NC_010695	CGG	2	6	1497	1502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010695	GTG	2	6	1516	1521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010695	GTG	2	6	1527	1532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010695	TAC	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010695	GTGA	2	8	1761	1768	25 %	25 %	50 %	0 %	188535906
37	NC_010695	AGC	2	6	1783	1788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535906
38	NC_010695	A	6	6	1819	1824	100 %	0 %	0 %	0 %	188535906
39	NC_010695	TTTTGA	2	12	1865	1876	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188535906
40	NC_010695	CTT	2	6	1890	1895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535906
41	NC_010695	AAT	2	6	1914	1919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535906
42	NC_010695	AGA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535906
43	NC_010695	TAT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535906
44	NC_010695	AGC	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535906
45	NC_010695	ATAG	2	8	2097	2104	50 %	25 %	25 %	0 %	188535906
46	NC_010695	ATT	2	6	2105	2110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535906
47	NC_010695	TGA	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535906
48	NC_010695	ATC	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535906
49	NC_010695	AAT	2	6	2211	2216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535906
50	NC_010695	ATACA	2	10	2285	2294	60 %	20 %	0 %	20 %	188535906
51	NC_010695	TGA	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535906
52	NC_010695	TGC	2	6	2406	2411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535906
53	NC_010695	GAC	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535906
54	NC_010695	ATT	2	6	2434	2439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535906
55	NC_010695	AT	4	8	2566	2573	50 %	50 %	0 %	0 %	188535906
56	NC_010695	TAA	2	6	2582	2587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535906
57	NC_010695	AC	3	6	2632	2637	50 %	0 %	0 %	50 %	188535906
58	NC_010695	A	8	8	2684	2691	100 %	0 %	0 %	0 %	188535906
59	NC_010695	CAT	2	6	2693	2698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535906
60	NC_010695	TGA	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535906
61	NC_010695	A	6	6	2727	2732	100 %	0 %	0 %	0 %	188535906
62	NC_010695	TCC	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188535906
63	NC_010695	T	7	7	2804	2810	0 %	100 %	0 %	0 %	188535906
64	NC_010695	GAA	2	6	2831	2836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535906
65	NC_010695	TGGGT	2	10	2843	2852	0 %	40 %	60 %	0 %	188535906
66	NC_010695	GT	3	6	2851	2856	0 %	50 %	50 %	0 %	188535906
67	NC_010695	TA	3	6	2857	2862	50 %	50 %	0 %	0 %	188535906
68	NC_010695	TGA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535906
69	NC_010695	A	6	6	2916	2921	100 %	0 %	0 %	0 %	188535906
70	NC_010695	CAA	2	6	2929	2934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535906
71	NC_010695	TAC	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535906
72	NC_010695	ACC	2	6	2994	2999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535906
73	NC_010695	CAT	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535906
74	NC_010695	GAGG	2	8	3051	3058	25 %	0 %	75 %	0 %	188535906
75	NC_010695	A	7	7	3077	3083	100 %	0 %	0 %	0 %	188535906
76	NC_010695	AAT	2	6	3104	3109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535906
77	NC_010695	CA	3	6	3181	3186	50 %	0 %	0 %	50 %	188535906
78	NC_010695	TA	3	6	3225	3230	50 %	50 %	0 %	0 %	188535906
79	NC_010695	GAG	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535906
80	NC_010695	AGA	2	6	3389	3394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535906
81	NC_010695	TGA	2	6	3415	3420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535906
82	NC_010695	AGC	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535906
83	NC_010695	AG	3	6	3620	3625	50 %	0 %	50 %	0 %	188535906
84	NC_010695	GCT	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
85	NC_010695	TGA	2	6	3732	3737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535907
86	NC_010695	GCGCT	2	10	3823	3832	0 %	20 %	40 %	40 %	188535907
87	NC_010695	GCT	2	6	3867	3872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
88	NC_010695	CTG	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
89	NC_010695	TCT	2	6	3980	3985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535907
90	NC_010695	TCAG	2	8	4058	4065	25 %	25 %	25 %	25 %	188535907
91	NC_010695	A	6	6	4085	4090	100 %	0 %	0 %	0 %	188535907
92	NC_010695	ACG	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
93	NC_010695	GAAA	2	8	4224	4231	75 %	0 %	25 %	0 %	188535907
94	NC_010695	TGA	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535907
95	NC_010695	CGAAAG	2	12	4280	4291	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	188535907
96	NC_010695	GAG	2	6	4318	4323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535907
97	NC_010695	CCA	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535907
98	NC_010695	AATA	2	8	4426	4433	75 %	25 %	0 %	0 %	188535907
99	NC_010695	GTG	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535907
100	NC_010695	TGC	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
101	NC_010695	ACG	2	6	4523	4528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
102	NC_010695	TGG	2	6	4574	4579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535907
103	NC_010695	AGG	2	6	4658	4663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535907
104	NC_010695	A	6	6	4723	4728	100 %	0 %	0 %	0 %	188535907
105	NC_010695	CAGCT	2	10	4732	4741	20 %	20 %	20 %	40 %	188535907
106	NC_010695	CTG	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
107	NC_010695	CAA	2	6	4851	4856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535907
108	NC_010695	CTG	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
109	NC_010695	GAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535907
110	NC_010695	CTG	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
111	NC_010695	AGC	3	9	5005	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
112	NC_010695	AAC	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535907
113	NC_010695	CGG	3	9	5232	5240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535907
114	NC_010695	CCG	2	6	5282	5287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535907
115	NC_010695	AGC	3	9	5335	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
116	NC_010695	CCG	2	6	5396	5401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535907
117	NC_010695	GAG	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535907
118	NC_010695	AG	3	6	5498	5503	50 %	0 %	50 %	0 %	188535907
119	NC_010695	TTC	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535907
120	NC_010695	TCACCG	2	12	5603	5614	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	188535907
121	NC_010695	CCG	2	6	5636	5641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535907
122	NC_010695	CTG	2	6	5665	5670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
123	NC_010695	CTG	2	6	5680	5685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
124	NC_010695	TC	3	6	5688	5693	0 %	50 %	0 %	50 %	188535907
125	NC_010695	CAGC	2	8	5745	5752	25 %	0 %	25 %	50 %	188535907
126	NC_010695	CCG	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535907
127	NC_010695	A	6	6	5842	5847	100 %	0 %	0 %	0 %	188535907
128	NC_010695	ACG	2	6	5939	5944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
129	NC_010695	TGC	2	6	5954	5959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
130	NC_010695	CGG	2	6	6000	6005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535907
131	NC_010695	TCA	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535907
132	NC_010695	CTG	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
133	NC_010695	GAAA	2	8	6120	6127	75 %	0 %	25 %	0 %	188535907
134	NC_010695	TGAT	2	8	6164	6171	25 %	50 %	25 %	0 %	188535907
135	NC_010695	GATG	2	8	6222	6229	25 %	25 %	50 %	0 %	188535907
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.